Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRX1P78414 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRX1P78414 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRX1P78414 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms