Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms