Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms