Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLTPP55058 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLTPP55058 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLTPP55058 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLTPP55058 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms