Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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PGGT1BP53609 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PGGT1BP53609 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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