Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms