Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTPAP49638 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTPAP49638 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms