Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FNTAP49354 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNTAP49354 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FNTAP49354 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FNTAP49354 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms