Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM4P49221 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM4P49221 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TGM4P49221 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms