Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXNP49023 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXNP49023 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXNP49023 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXNP49023 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXNP49023 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXNP49023 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXNP49023 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXNP49023 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXNP49023 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXNP49023 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXNP49023 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXNP49023 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXNP49023 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXNP49023 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXNP49023 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms