Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms