Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms