Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGCXP38435 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms