Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms