Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGM1P36871 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGM1P36871 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms