Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms