Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX2P28328 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX2P28328 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms