Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT1P26358 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms