Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms