Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5F1P24539 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms