Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRAP18433 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRAP18433 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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