Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTPS1P17812 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTPS1P17812 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms