Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB3P14651 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms