Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRG2P13727 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms