Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms