Protein–RNA interactions for Protein: P05114

HMGN1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1P05114 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGN1P05114 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms