Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TYMSP04818 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TYMSP04818 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TYMSP04818 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms