Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms