Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TIMM17BO60830 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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