Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKAB2O43741 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms