Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTSS1O43312 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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