Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms