Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRTO14522 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms