Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms