Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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