Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NL46 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NL46 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NL46 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NL46 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms