Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms