Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms