Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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