Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TPRKBQ9Y3C4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms