Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT11Q9UKZ1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms