Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP2BPQ9P2M1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms