Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms