Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms