Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms