Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms