Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms