Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms