Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms