Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms